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Após seu martírio, os cristãos enterraram os corpos dos santos Ciro e João numa igreja dedicada ao santo Apóstolo Marcos em Canopo. Embora a igreja tenha se tornado um centro de peregrinação, a vila provocava medo entre os egípcios, pois a cidade abrigava templos pagãos habitados por espíritos malignos que não hesitavam em aparecer aos habitantes em sonho. Teófilo I, Patriarca de Alexandria (385–412), ansiava pela limpeza desse lugar dos demônios, mas logo veio a falecer. Seu sucessor, São Cirilo I, Patriarca de Alexandria (412–444), pôs em prática seu desejo, orando fervorosamente por sua conclusão.
Em 412, um anjo de Deus apareceu ao hierarca em uma visão, ordenando que as veneráveis relíquias fossem transferidas a Menutis, poucos quilômetros ao leste. Sua Santidade realizou o mandamento do anjo e construiu lá uma igreja dedicada aos santos mártires. Em 28 de junho de 414, suas sagradas relíquias foram transferidas para a igreja. São Cirilo pôde também destruir o templo pagão à deusa Ísis, e erigiu um santuário dedicado aos santos em c. 427. Menutis, então, tornou-se um dos lugares mais peregrinados do Egito até sua queda para os pelos islâmicos no século VII.
Com a construção do santuário, o lugar foi purificado da presença do inimigo demoníaca e, pelas orações dos santos anárgiros, começaram a ocorrer vários milagres e curas nos enfermos. Do que se tem registro, Amônio, filho de Juliano, o prefeito de Alexandria, foi curado de tuberculose, outros foram curados de cegueira, doenças no pulmão, envenenamento e edemas através da veneração de suas relíquias. Era frequente ver pessoas dormirem ao lado de seus túmulos na esperança de receberem uma visão dos santos (prática essa denominada ''incubação''). Nessas visões, ou os santos receitavam o tratamento ou eles próprios curavam o fiel enquanto dormia.
Através dos inúmeros milagres realizados pelos anárgiros, muitos renunciaram ao paganismo e aceitaram a Fé cristã. O nome de Canopo foi mudado para Abuquir (''Abba Kyr'') em honra a São Ciro e, ainda na era de São Cirilo, todos os templos pagãos em Menutis foram destruídos. Em 634, antes da Queda do Egito, em meio à heresia monotelista apoiada por CiriloCiro, Patriarca de Alexandria (631–643), suas relíquias foram levadas para a Igreja de Santa Passera, em Roma. Seu nome é uma corruptela de ''[Ab]bas Cyrus''.
No século VII, São Sofrônio, Patriarca de Jerusalém (634–638), foi curado de uma enfermidade na visão a qual os médicos diziam ser incurável através de uma aparição dos dois santos. Ciro curou um de seus olhos com o sinal da Cruz; João curou o outro beijando seu olho. Para demonstrar sua gratidão, São Sofrônio escreveu um detalhado registro de seus setenta milagres junto de um louvor aos santos. Em algum ponto na história, suas relíquias foram transferidas para Munique na Alemanha.
