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[[Imagem:Fatih.jpg|miniatura|A Igreja dos Santos Apóstolos foi reduzida a ruínas durante as cruzadas e depois reconstruída como uma mesquita.]]
[[Imagem:Termoli Cathedral.jpg|miniatura|A Catedral de Termoli foi construída durante o século VI.]]
Seu corpo foi enterrado pelos cristãos. No século IV, as santas relíquias de São Timóteo foram transferidas a Constantinopla e postas na Igreja dos Santos Apóstolos, próximo aos sepulcros de Santo André, São Lucas e [[Gregório, o Teólogo|São Gregório, o Teólogo]]. A basílica igreja também abrigou as relíquias de [[João , o Crisóstomo|São João , o Crisóstomo]] e de São Nicéforo I, Patriarca de Constantinopla (806–815).
No século XIII, durante o Saque de Constantinopla (1204), os cruzados espoliaram a Igreja dos Santos Apóstolos. Do que se tem registro, até o túmulo de seu próprio reconstrutor, o santo Imperador Justiniano, o Grande (527–565), foi arrombado e saqueado. A coroa do Imperador Heraclião ainda com os seus cabelos e os corpos de São Gregório e São Timóteo foram todos levados à Itália. Em 1239, as santas relíquias de São Timóteo foram escondidas no chão da Catedral de Termoli, na Itália central, e lá caíram no esquecimento por sete séculos. Em 1945, com o fim da Segunda Guerra Mundial e o início da restauração da catedral, as relíquias foram reencontradas.
