Em 1855, foi enviado à Kronstadt - uma região não tão longe de São Petersburgo, porém bastante desfavorecida - para servir na Catedral de Santo André em Kronstadt. Assim que dera seu primeiro passo na catedral, percebeu que a sua visão de infância havia se concretizado. Casou-se com a em Elizabeth, filha do arcipreste Nesvitsky. O casal nunca tivera filhos. Desde o primeiro momento, São João expressou seu desejo por manter sua castidade e viver ao lado de um arcipreste Elizabeth como irmão e, pouco tempo mais tardeirmã. O desejo foi aceito pela esposa. Naquele mesmo ano, foi [[Ordenação|ordenado]] ao sacerdócio.